Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA2O43364 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA2O43364 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms