Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTSS1O43312 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms