Protein–RNA interactions for Protein: O15417

TNRC18, Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC18O15417 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNRC18O15417 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNRC18O15417 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms