Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHADO15335 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHADO15335 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHADO15335 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHADO15335 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHADO15335 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHADO15335 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHADO15335 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHADO15335 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHADO15335 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHADO15335 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHADO15335 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHADO15335 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHADO15335 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHADO15335 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHADO15335 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHADO15335 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHADO15335 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHADO15335 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHADO15335 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHADO15335 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHADO15335 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHADO15335 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHADO15335 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHADO15335 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHADO15335 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHADO15335 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHADO15335 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHADO15335 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHADO15335 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHADO15335 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHADO15335 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHADO15335 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHADO15335 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHADO15335 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHADO15335 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHADO15335 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHADO15335 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHADO15335 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHADO15335 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHADO15335 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHADO15335 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHADO15335 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHADO15335 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHADO15335 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHADO15335 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHADO15335 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHADO15335 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHADO15335 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHADO15335 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHADO15335 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHADO15335 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHADO15335 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHADO15335 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHADO15335 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHADO15335 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHADO15335 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHADO15335 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHADO15335 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHADO15335 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHADO15335 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHADO15335 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHADO15335 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHADO15335 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHADO15335 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHADO15335 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHADO15335 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHADO15335 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHADO15335 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHADO15335 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHADO15335 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHADO15335 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHADO15335 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHADO15335 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHADO15335 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHADO15335 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHADO15335 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHADO15335 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHADO15335 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHADO15335 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHADO15335 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHADO15335 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHADO15335 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHADO15335 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHADO15335 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHADO15335 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHADO15335 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHADO15335 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHADO15335 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHADO15335 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHADO15335 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHADO15335 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHADO15335 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHADO15335 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHADO15335 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHADO15335 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHADO15335 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHADO15335 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHADO15335 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHADO15335 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms