Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ARPC1BO15143 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms