Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHUKO15111 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHUKO15111 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHUKO15111 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHUKO15111 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHUKO15111 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHUKO15111 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHUKO15111 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHUKO15111 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHUKO15111 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHUKO15111 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHUKO15111 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHUKO15111 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHUKO15111 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHUKO15111 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHUKO15111 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHUKO15111 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHUKO15111 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHUKO15111 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHUKO15111 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHUKO15111 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHUKO15111 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHUKO15111 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHUKO15111 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHUKO15111 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHUKO15111 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHUKO15111 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHUKO15111 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHUKO15111 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHUKO15111 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHUKO15111 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHUKO15111 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHUKO15111 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHUKO15111 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHUKO15111 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHUKO15111 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHUKO15111 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHUKO15111 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHUKO15111 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHUKO15111 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHUKO15111 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHUKO15111 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHUKO15111 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHUKO15111 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHUKO15111 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHUKO15111 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHUKO15111 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHUKO15111 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHUKO15111 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHUKO15111 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHUKO15111 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHUKO15111 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHUKO15111 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHUKO15111 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHUKO15111 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHUKO15111 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHUKO15111 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHUKO15111 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHUKO15111 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHUKO15111 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHUKO15111 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHUKO15111 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHUKO15111 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHUKO15111 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHUKO15111 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHUKO15111 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHUKO15111 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHUKO15111 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHUKO15111 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHUKO15111 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHUKO15111 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHUKO15111 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHUKO15111 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHUKO15111 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHUKO15111 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHUKO15111 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHUKO15111 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHUKO15111 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHUKO15111 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHUKO15111 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHUKO15111 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHUKO15111 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHUKO15111 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHUKO15111 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHUKO15111 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHUKO15111 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHUKO15111 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHUKO15111 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHUKO15111 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHUKO15111 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHUKO15111 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHUKO15111 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHUKO15111 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHUKO15111 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHUKO15111 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHUKO15111 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHUKO15111 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHUKO15111 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHUKO15111 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHUKO15111 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms