Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCF2LO15068 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms