Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPRTO14522 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
PTPRTO14522 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRTO14522 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
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