Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX7O00628 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX7O00628 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX7O00628 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX7O00628 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX7O00628 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX7O00628 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX7O00628 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX7O00628 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX7O00628 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX7O00628 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX7O00628 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX7O00628 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX7O00628 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX7O00628 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX7O00628 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX7O00628 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX7O00628 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX7O00628 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX7O00628 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX7O00628 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PEX7O00628 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX7O00628 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX7O00628 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX7O00628 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX7O00628 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX7O00628 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX7O00628 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX7O00628 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX7O00628 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX7O00628 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX7O00628 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX7O00628 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX7O00628 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX7O00628 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX7O00628 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX7O00628 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PEX7O00628 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX7O00628 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX7O00628 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX7O00628 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX7O00628 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX7O00628 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX7O00628 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX7O00628 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX7O00628 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PEX7O00628 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PEX7O00628 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX7O00628 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX7O00628 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX7O00628 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX7O00628 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX7O00628 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX7O00628 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX7O00628 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PEX7O00628 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX7O00628 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX7O00628 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX7O00628 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX7O00628 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX7O00628 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX7O00628 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX7O00628 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX7O00628 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX7O00628 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX7O00628 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX7O00628 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX7O00628 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX7O00628 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX7O00628 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX7O00628 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX7O00628 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX7O00628 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX7O00628 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX7O00628 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX7O00628 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PEX7O00628 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX7O00628 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX7O00628 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX7O00628 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX7O00628 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX7O00628 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX7O00628 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX7O00628 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX7O00628 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX7O00628 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX7O00628 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX7O00628 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX7O00628 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX7O00628 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX7O00628 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX7O00628 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX7O00628 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX7O00628 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX7O00628 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PEX7O00628 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX7O00628 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX7O00628 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX7O00628 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PEX7O00628 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms