Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
CCER2I3L3R5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCER2I3L3R5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCER2I3L3R5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms