Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BRM9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BRM9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BRM9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BRM9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BRM9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BRM9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BRM9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BRM9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BRM9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BRM9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BRM9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BRM9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BRM9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BRM9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BRM9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BRM9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BRM9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BRM9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BRM9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BRM9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BRM9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BRM9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BRM9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3BRM9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BRM9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BRM9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BRM9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BRM9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BRM9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BRM9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BRM9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BRM9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BRM9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BRM9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BRM9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BRM9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BRM9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BRM9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BRM9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BRM9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BRM9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BRM9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BRM9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BRM9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BRM9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BRM9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BRM9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BRM9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BRM9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BRM9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BRM9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3BRM9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3BRM9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3BRM9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3BRM9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3BRM9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3BRM9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3BRM9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BRM9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BRM9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BRM9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BRM9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BRM9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BRM9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BRM9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BRM9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BRM9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BRM9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BRM9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BRM9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3BRM9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms