Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CLDN25C9JDP6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLDN25C9JDP6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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