Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DGG1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DGG1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DGG1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DGG1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DGG1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DGG1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4DGG1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4DGG1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4DGG1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4DGG1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4DGG1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4DGG1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4DGG1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4DGG1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4DGG1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4DGG1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DGG1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DGG1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DGG1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DGG1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DGG1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DGG1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DGG1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DGG1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DGG1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DGG1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DGG1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DGG1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DGG1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DGG1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DGG1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DGG1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DGG1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DGG1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DGG1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DGG1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DGG1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DGG1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DGG1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DGG1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DGG1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DGG1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DGG1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DGG1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DGG1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
B4DGG1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
B4DGG1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
B4DGG1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
B4DGG1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
B4DGG1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
B4DGG1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DGG1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
B4DGG1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
B4DGG1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DGG1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DGG1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DGG1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
B4DGG1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DGG1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
B4DGG1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
B4DGG1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DGG1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DGG1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DGG1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
B4DGG1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B4DGG1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
B4DGG1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B4DGG1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
B4DGG1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
B4DGG1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
B4DGG1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.31■■□□□ 1
B4DGG1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
B4DGG1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
B4DGG1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
B4DGG1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DGG1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DGG1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
B4DGG1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DGG1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
B4DGG1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DGG1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DGG1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
B4DGG1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
B4DGG1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
B4DGG1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DGG1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
B4DGG1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B4DGG1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
B4DGG1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
B4DGG1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B4DGG1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
B4DGG1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
B4DGG1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.29■■□□□ 1
B4DGG1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.29■■□□□ 1
B4DGG1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B4DGG1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.29■■□□□ 1
B4DGG1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.29■■□□□ 1
B4DGG1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B4DGG1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms