Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VGLL3A8MV65 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms