Protein–RNA interactions for Protein: A8MSI8

LYRM9, LYR motif-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM9A8MSI8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LYRM9A8MSI8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM9A8MSI8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM9A8MSI8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM9A8MSI8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM9A8MSI8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM9A8MSI8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM9A8MSI8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM9A8MSI8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM9A8MSI8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM9A8MSI8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM9A8MSI8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM9A8MSI8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM9A8MSI8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM9A8MSI8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYRM9A8MSI8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms