Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC160A6NGH7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC160A6NGH7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms