Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C5orf51A6NDU8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C5orf51A6NDU8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C5orf51A6NDU8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C5orf51A6NDU8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C5orf51A6NDU8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C5orf51A6NDU8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C5orf51A6NDU8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C5orf51A6NDU8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C5orf51A6NDU8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C5orf51A6NDU8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C5orf51A6NDU8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C5orf51A6NDU8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C5orf51A6NDU8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C5orf51A6NDU8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C5orf51A6NDU8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C5orf51A6NDU8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C5orf51A6NDU8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C5orf51A6NDU8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C5orf51A6NDU8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C5orf51A6NDU8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C5orf51A6NDU8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C5orf51A6NDU8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C5orf51A6NDU8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C5orf51A6NDU8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms