Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POTEFA5A3E0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POTEFA5A3E0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms