Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms