Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YY99

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YY99 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0J9YY99 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0J9YY99 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms