Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ST6GAL1-215ENST00000457772 3947 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 NXPE4-201ENST00000375478 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SIGLEC10-209ENST00000525998 1841 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 VAMP7-201ENST00000262640 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ZNF789-209ENST00000483089 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AL121772.1-201ENST00000618303 2335 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AL592490.1-201ENST00000409186 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AMBRA1-201ENST00000314845 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ATP6AP1-210ENST00000619046 2823 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AL353593.1-201ENST00000602517 3955 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 MIR324-201ENST00000362183 83 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CITED1-206ENST00000431381 941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CITED1-207ENST00000445983 820 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC012146.4-201ENST00000575546 271 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ZNF814-215ENST00000614383 2006 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ASPH-208ENST00000517856 6337 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 MYO18B-201ENST00000335473 8565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 MAP1A-201ENST00000300231 10258 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PUDP-201ENST00000381077 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CMTR2-202ENST00000434935 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PAXIP1-AS2-203ENST00000449486 2121 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 MDM1-204ENST00000411698 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TOP1MT-213ENST00000521193 1960 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PHB-214ENST00000614445 1952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC092902.5-201ENST00000641650 3256 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 IL18BP-209ENST00000497194 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SNAI1-201ENST00000244050 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CTCFL-211ENST00000502686 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TNS2-210ENST00000549700 4525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ZNF341-201ENST00000342427 3661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ESPNL-206ENST00000612395 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CAPN1-208ENST00000527323 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 DNM1L-220ENST00000549701 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SLC12A8-202ENST00000430155 2831 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 MYH11-202ENST00000396324 6847 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ZNF23-201ENST00000357254 3186 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 NPNT-202ENST00000379987 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TPRX1-203ENST00000543508 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SCN8A-208ENST00000599343 5976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 MTHFSD-201ENST00000360900 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ADCK1-202ENST00000341211 1972 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 C16orf78-201ENST00000299191 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 RPSAP67-201ENST00000584105 862 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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