Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PRPF40A-202ENST00000410080 8048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ACR-201ENST00000216139 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 RD3-201ENST00000367002 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ZFAT-208ENST00000520356 4273 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 FAM198B-202ENST00000393807 4544 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 LHFPL5-201ENST00000360215 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ZNF648-201ENST00000339948 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AGPAT1-206ENST00000395499 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 G3BP1-201ENST00000356245 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ZNF627-201ENST00000361113 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 FRMD6-204ENST00000553556 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ETF1-202ENST00000499810 3874 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AL359317.2-201ENST00000554898 1826 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AL713866.1-201ENST00000563320 3125 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 RPAP1-201ENST00000304330 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 OR13A1-203ENST00000553795 2078 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 STRADA-253ENST00000640979 2086 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 MAGEB10-201ENST00000356790 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC126323.1-203ENST00000562306 2579 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 OTOG-201ENST00000342528 4992 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 MYOZ3-201ENST00000297130 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 FAM110B-201ENST00000361488 3438 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ZBTB1-203ENST00000554015 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PLSCR1-201ENST00000342435 2233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 NARS-201ENST00000256854 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PDCD11-201ENST00000369797 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC100788.1-201ENST00000591108 945 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 MNAT1-201ENST00000261245 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC140481.3-201ENST00000450440 1762 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TACR1-201ENST00000305249 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 GNB5-201ENST00000261837 8906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 OSBPL9-207ENST00000462759 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 NCAM1-230ENST00000621850 2787 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 FP565260.1-201ENST00000617716 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ATXN7L3B-201ENST00000519948 7604 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 HACD3-207ENST00000566074 1658 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 JAK1-201ENST00000342505 5047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PRDM2-204ENST00000376048 2688 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 RIC3-203ENST00000343202 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PKP1-201ENST00000263946 5447 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 DERL1-201ENST00000259512 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ANKLE2-208ENST00000542282 3302 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TP53-208ENST00000504290 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TP53-220ENST00000610623 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AKR1B10-201ENST00000359579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PIK3R3-201ENST00000262741 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PIP5K1A-203ENST00000368890 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 SPATS2L-208ENST00000409718 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 SLC44A4-210ENST00000544672 2634 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PLEKHG3-204ENST00000484731 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ABRA-201ENST00000311955 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 UBASH3A-202ENST00000319294 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 DAPK1-219ENST00000622514 5772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 RALBP1-202ENST00000383432 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 KCNMB3-203ENST00000392685 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 DENND2A-209ENST00000496613 3562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 NOL10-201ENST00000345985 3333 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 RFC3-201ENST00000380071 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ACAN-208ENST00000561243 7593 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 BET1-201ENST00000222547 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 MRPL48-201ENST00000310614 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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