Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 LOXL3-201ENST00000264094 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 TAF1C-203ENST00000541676 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 MET-201ENST00000318493 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 FAM225B-201ENST00000423546 5629 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 NR1I2-207ENST00000640105 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 LINC02003-201ENST00000577573 1833 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AL512383.1-201ENST00000624175 2677 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ARHGAP6-205ENST00000380736 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 FYN-201ENST00000229471 2009 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 MRGPRX2-201ENST00000329773 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 CETP-202ENST00000379780 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SIN3A-208ENST00000567289 4078 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 EFCAB13-201ENST00000331493 3931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SYNPO2L-201ENST00000372873 4121 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 EYA3-202ENST00000373864 2459 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 PISD-201ENST00000266095 2655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ITPR1-219ENST00000544951 4131 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SRGAP2-AS1-202ENST00000437515 2504 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 TRMT61B-201ENST00000306108 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SLC12A3-201ENST00000262502 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 PCDHGA9-202ENST00000616887 2568 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 IP6K3-202ENST00000451316 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 FRMD6-204ENST00000553556 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ACVR1-203ENST00000410057 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 RAB29-202ENST00000367139 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 WBP11-201ENST00000261167 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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LSAMPQ13449 FAM47B-201ENST00000329357 2120 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 FCGR2B-202ENST00000358671 2115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 UBE2V1-203ENST00000371674 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SEC14L1-203ENST00000431431 2504 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC004490.1-201ENST00000585593 2738 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 C12orf74-202ENST00000544406 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 TRPV2-201ENST00000338560 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ZNF483-203ENST00000358151 2433 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AVL9-202ENST00000409301 4336 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 COASY-201ENST00000393818 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 MMS19-203ENST00000370782 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 DLGAP1-218ENST00000581527 3525 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ILK-202ENST00000396751 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 IQCD-202ENST00000416617 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC068580.4-203ENST00000636397 4038 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
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