Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC034102.3-201ENST00000551846 300 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 RMND5B-210ENST00000515098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 CYLD-214ENST00000569418 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 METTL3-201ENST00000298717 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 TRIM40-206ENST00000376724 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 DLX5-201ENST00000222598 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SPDYE8P-201ENST00000333385 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SPDYE11-201ENST00000340073 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SPDYE9P-203ENST00000575125 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AOC2-201ENST00000253799 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 LINC02202-201ENST00000499583 2664 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 ELP4-202ENST00000379163 1700 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SPTLC1-201ENST00000262554 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 UGT1A1-201ENST00000305208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 RNA5SP248-201ENST00000365602 127 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 KRT18P63-201ENST00000505463 979 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 LINC01471-201ENST00000461398 3079 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 MAGEB10-201ENST00000356790 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 LINC01227-205ENST00000567317 1338 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC023355.1-202ENST00000612262 4242 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 CDC25C-202ENST00000348983 1951 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 UBE2V1-207ENST00000420027 1956 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AGA-201ENST00000264595 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms