Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC002480.2-201ENST00000435127 2432 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 GINS3-202ENST00000328514 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AL391421.1-201ENST00000372387 1922 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 PCDHAC1-201ENST00000253807 5299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 OPRM1-204ENST00000360422 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CAMTA2-208ENST00000572543 4496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ZNF549-201ENST00000240719 3969 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 BRINP2-201ENST00000361539 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AMIGO2-203ENST00000550413 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ESR1-201ENST00000206249 6458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CCND1-201ENST00000227507 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 EXD2-204ENST00000409242 2496 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ARMC9-215ENST00000614261 4975 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 UHRF1-206ENST00000622802 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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LSAMPQ13449 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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LSAMPQ13449 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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LSAMPQ13449 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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LSAMPQ13449 TRUB1-201ENST00000298746 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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LSAMPQ13449 METTL16-201ENST00000263092 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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LSAMPQ13449 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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LSAMPQ13449 TBCEL-202ENST00000422003 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MLC1-202ENST00000395876 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 DLG1-215ENST00000448528 2977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 SETMAR-201ENST00000358065 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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LSAMPQ13449 BRD2-205ENST00000449085 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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LSAMPQ13449 UGT1A4-201ENST00000373409 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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LSAMPQ13449 LYPD6-201ENST00000334166 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 RANBP3-203ENST00000439268 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 DAB1-203ENST00000371231 1802 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CR769775.4-201ENST00000638516 4139 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 FGD3-202ENST00000375482 3321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 EPB41L1-212ENST00000441639 5967 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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