Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 PLK4-210ENST00000514379 3060 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SLC25A30-207ENST00000539591 3608 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AP003108.3-201ENST00000623765 2234 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 PCDHA10-202ENST00000506939 3788 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 CCDC88A-214ENST00000621814 3089 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 FAM156A-203ENST00000611661 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 DZANK1-201ENST00000262547 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC010182.1-201ENST00000548943 2434 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 RCBTB2-206ENST00000544904 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AL592295.4-201ENST00000636161 997 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 LINC02140-202ENST00000566649 2017 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 TMEM185A-210ENST00000613273 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 PCSK7-215ENST00000540028 3332 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 BBOF1-201ENST00000394009 3106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC005549.1-201ENST00000579438 1629 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AL591368.1-201ENST00000437181 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 TGOLN2-206ENST00000444342 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 ZP4-201ENST00000366570 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 DGKZP1-201ENST00000378718 2776 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 KRT40-201ENST00000377755 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AP003063.2-201ENST00000525984 2067 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 ANKDD1A-201ENST00000319580 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 TEPP-201ENST00000290871 1079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP2O75323 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms