Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 CEP170-204ENST00000366544 6805 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 LINGO1-AS1-201ENST00000558691 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 FOXJ3-201ENST00000361346 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TBC1D3I-203ENST00000621034 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 RECQL5-204ENST00000423245 3576 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 POM121L1P-202ENST00000605258 1835 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 LARGE1-202ENST00000397394 4138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CDC42BPA-203ENST00000366766 10610 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 PLEKHG4-202ENST00000379344 4513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 KIF22-202ENST00000400751 2493 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 THUMPD3-206ENST00000452837 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 KCNH6-201ENST00000314672 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CACNA1C-213ENST00000399629 6562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 RP2-201ENST00000218340 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ZMYND11-203ENST00000381591 4229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CASZ1-201ENST00000344008 4405 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 PMEPA1-205ENST00000395816 4519 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 PTPRS-201ENST00000262963 4766 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 NFXL1-201ENST00000329043 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ALOX15P2-201ENST00000340858 1897 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 LDB3-203ENST00000372056 1868 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 BCL2L11-206ENST00000393256 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 LDLRAD1-203ENST00000420619 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC005076.1-201ENST00000433446 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 DLGAP2-AS1-201ENST00000518009 1810 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ZFP37-203ENST00000555206 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 PTPRS-210ENST00000592099 4766 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AL357509.1-201ENST00000641892 2013 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 DPY19L1-201ENST00000310974 4870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TBC1D31-201ENST00000287380 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ADGRD1-202ENST00000335486 2892 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 HNRNPF-202ENST00000356053 2670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 HNRNPF-207ENST00000544000 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 SLC4A1AP-206ENST00000618046 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 PLAU-201ENST00000372764 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TRIM40-206ENST00000376724 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ESPNL-203ENST00000409506 3610 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 DCAF6-204ENST00000432587 3522 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 GIMAP6-201ENST00000328902 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 IP6K1-201ENST00000321599 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TMPO-212ENST00000556029 4242 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 KDM6A-201ENST00000377967 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 RIOK3-201ENST00000339486 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ASPH-203ENST00000379454 5268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 C14orf159-203ENST00000412671 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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