Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQN1

FAM83C, Protein FAM83C, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83CQ9BQN1 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 ATAT1-204ENST00000330083 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 CDC25C-202ENST00000348983 1951 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 KIR3DL3-201ENST00000291860 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 ECM1-203ENST00000369049 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 BCO2-202ENST00000361053 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 AL807752.1-201ENST00000395082 1322 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 HACD3-210ENST00000568793 1824 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 HIST1H2BN-201ENST00000396980 432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 AL359094.2-201ENST00000420941 750 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 HLA-DQB3-203ENST00000425319 356 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 TMEM91-206ENST00000447302 721 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 AL929472.4-201ENST00000447422 691 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 RN7SL477P-201ENST00000488440 286 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 LDHAL6CP-201ENST00000502352 1142 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 CHCHD10-204ENST00000520222 384 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 OR5BA1P-201ENST00000529722 982 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 ORMDL2-204ENST00000550836 438 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 AC021755.2-201ENST00000559022 461 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 PSMD7-205ENST00000568615 931 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 IST1-221ENST00000544564 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 ZCWPW1-208ENST00000490721 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM83CQ9BQN1 RETREG3-203ENST00000585894 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 NBEAP3-201ENST00000420638 1493 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 NNMT-201ENST00000299964 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 POTEC-201ENST00000358970 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 DPF2-202ENST00000415073 2085 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 SULT1A3-202ENST00000395138 1326 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 TBC1D3I-201ENST00000616671 1982 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 SLC37A3-203ENST00000447932 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 AL357054.1-201ENST00000407035 1227 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 AL365194.1-201ENST00000440032 361 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM83CQ9BQN1 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms