Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX8Q9Y5X2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX8Q9Y5X2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms