Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FARP1Q9Y4F1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FARP1Q9Y4F1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms