Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCAF1Q9Y4C2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCAF1Q9Y4C2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms