Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB1Q9Y478 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms