Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKP3Q9Y446 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms