Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED3Q9Y3Q3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED3Q9Y3Q3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms