Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN8AQ9UQD0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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