Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SHOC2Q9UQ13 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHOC2Q9UQ13 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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