Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX7Q9UNH6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX7Q9UNH6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX7Q9UNH6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX7Q9UNH6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX7Q9UNH6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX7Q9UNH6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX7Q9UNH6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX7Q9UNH6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX7Q9UNH6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX7Q9UNH6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX7Q9UNH6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX7Q9UNH6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX7Q9UNH6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX7Q9UNH6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX7Q9UNH6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX7Q9UNH6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX7Q9UNH6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX7Q9UNH6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms