Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP18Q9UMW8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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