Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PADI4Q9UM07 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PADI4Q9UM07 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms