Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT6Q9ULM6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT6Q9ULM6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms