Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PNMA2Q9UL42 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms