Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX7

NUP50, Nuclear pore complex protein Nup50, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50Q9UKX7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUP50Q9UKX7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUP50Q9UKX7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms