Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF3C4Q9UKN8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms