Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA2Q9UJY4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GGA2Q9UJY4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms