Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3BQ9UH17 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms