Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEPT3Q9UH03 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEPT3Q9UH03 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms