Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRPC4Q9UBN4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRPC4Q9UBN4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms