Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF7Q9UBF6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF7Q9UBF6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF7Q9UBF6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF7Q9UBF6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF7Q9UBF6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF7Q9UBF6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF7Q9UBF6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF7Q9UBF6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF7Q9UBF6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF7Q9UBF6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF7Q9UBF6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF7Q9UBF6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF7Q9UBF6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF7Q9UBF6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF7Q9UBF6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF7Q9UBF6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF7Q9UBF6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF7Q9UBF6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF7Q9UBF6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF7Q9UBF6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF7Q9UBF6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF7Q9UBF6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF7Q9UBF6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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