Protein–RNA interactions for Protein: Q9P273

TENM3, Teneurin-3, humanhuman

Predictions only

Length 2,699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TENM3Q9P273 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TENM3Q9P273 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TENM3Q9P273 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TENM3Q9P273 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TENM3Q9P273 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TENM3Q9P273 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TENM3Q9P273 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TENM3Q9P273 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TENM3Q9P273 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TENM3Q9P273 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TENM3Q9P273 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TENM3Q9P273 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TENM3Q9P273 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TENM3Q9P273 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TENM3Q9P273 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TENM3Q9P273 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TENM3Q9P273 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TENM3Q9P273 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TENM3Q9P273 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TENM3Q9P273 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms