Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HCN3Q9P1Z3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms